LSMU HPC

---

️KAS YRA HPC?

HPC (High Performance Computing) – tai Universiteto aukšto našumo skaičiavimo sistema, skirta sudėtingų mokslinių skaičiavimų vykdymui. Ji susideda iš kelių galingų kompiuterių (skaičiavimo mašinų), sujungtų į vieną didelį “super kompiuterį”.

Kam naudoti HPC?
• Genomikai – NGS duomenų analizė (bakterinių bei eukariotinių genomų surinkimas iš sekoskaitos duomenų ir jų anotavimas).
• Metagenominei analizei – MAGs ir biocheminiai takai (read’ų klasifikacija, genomų surinkimas iš aplinkos pavyzdžių, anotavimas bei paruošimas statistinei analizei).
• Sekų analizei – BLAST ir homologijos paieška (lokalus sekų lygiavimas, genų bei baltymų identifikavimas ir lyginamoji analizė duomenų bazėse).
• Evoliuciniams tyrimams – Virusų filogenezė (skirtingų viruso kaminų genomų palyginimas ir evoliucinių ryšių modeliavimas).
• Molekuliniam modeliavimui – Molekulinė dinamika (molekulių ir jų kompleksų judėjimo bei sąveikų simuliacijos laike).
• Struktūrinei biologijai – AlphaFold (baltymų ir jų kompleksų 3D struktūrų prognozavimas naudojant naujausius dirbtinio intelekto įrankius).

Svarbu: HPC sistema nėra skirta įprastam darbui su dokumentais, interneto naršymui ar paprastiems skaičiavimams.